周永锋课题组

题目	Pangenomics and single-cell transcriptomics uncover the genetic basis of continuous bearing trait in grapevine
中文	泛基因组学和单细胞转录组学揭示了葡萄树连续结实性状的遗传基础
参考	Liu Y, Dong Y, Fang X, et al. Pangenomics and single-cell transcriptomics uncover the genetic basis of continuous bearing trait in grapevine[J]. Horticulture Research, 2025: uhaf228.
作者	刘玉婷, 董阳
通讯	冷翔鹏, 彭艳玲, 周永锋
期刊	Horticulture Research [2025-9-2 ] 原文链接文档查看文章下载
简介	葡萄（Vitis vinifera）在经济上具有重要意义，可用于新鲜食用、酿酒以及干燥处理。其开花和果实发育的昼夜节律系统对于葡萄栽培和产量形成至关重要。然而，关于持续开花和结果这一特性（CFB）的遗传基础却鲜有研究阐明。在此，我们通过整合泛基因组学、比较基因组学、单细胞转录组学和混合转录组学的方法，对“朱利安”葡萄的持续开花和结果特性（CFB）进行了研究。这种葡萄在从花到成熟浆果的不同发育阶段同时结出果实。泛基因组学和比较基因组学分析基于“朱利安”新生成的染色体分辨率近端着丝粒至端着丝粒（T2T）基因组以及15个先前发表的葡萄基因组（这些基因组中的葡萄果实处于相同发育阶段，即季节性开花和结果，SFB）发现了 558 个独特的结构变异（SVs）以及在朱利安中特异性富集于开花途径的 8 个基因。对“CFB‘朱利安’”和“SFB‘慕斯卡特汉堡’”的开花芽细胞进行转录组分析，发现了七种不同的细胞类型，这为这两个品种提供了详细的细胞类型特异性基因表达图谱，同时通过差异基因表达（DEG）分析揭示了“朱利安”品种中生长、代谢和激素调节途径的相关信息。结合结构变异（SV）和差异基因表达数据，我们确定了 37 个可能与 CFB 相关的候选基因，包括生长素/IAA、细胞色素 P450、类似维西林的抗菌肽（AMP）和呼吸爆发氧化酶同源蛋白 B（RBOH）相关基因。本研究为葡萄藤中 CFB 的遗传基础提供了见解，有助于通过持续开花和结果的葡萄栽培方法进行葡萄品种的培育。
封面